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**ループモデリング 問題意識:「ループ」というものを、どう定義するか。(・w・) + + 問題意識:環境の正しくなさをどう評価するか。 + +まわりのタンパク質(環境と呼ぶ)は、マジメにモデリングする前の +ループを含んで構造をとっている。 +→ってことは、二次構造の向きなんかは信頼できないかも? +→いやでも、二次構造の配向はループに決められてないかも。 + +それ以外にもいろいろ問題があるから、何にしても、 +環境の構造が正しいとは考えられない。 + +で、正しくない環境にあわせてモデリングしたループの構造は、 +正しくなるとはなかなか思えない。 + +どうしたらよいのであろう。こまったのである。 -------------------------