問題意識

ループモデリング


 問題意識:「ループ」というものを、どう定義するか。(・w・)


 問題意識:環境の正しくなさをどう評価するか。

まわりのタンパク質(環境と呼ぶ)は、マジメにモデリングする前の
ループを含んで構造をとっている。
→ってことは、二次構造の向きなんかは信頼できないかも?
→いやでも、二次構造の配向はループに決められてないかも。

それ以外にもいろいろ問題があるから、何にしても、
環境の構造が正しいとは考えられない。

で、正しくない環境にあわせてモデリングしたループの構造は、
正しくなるとはなかなか思えない。

どうしたらよいのであろう。こまったのである。






















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